单个细胞或有限的样本进行高度均一的全基因组扩增-产品资讯-资讯-生物在线

单个细胞或有限的样本进行高度均一的全基因组扩增

作者:杭州联科生物技术股份有限公司 2014-10-02T23:16 (访问量:2529)

您是否需要探索单细胞中的遗传信息?我们为您提供解决方案!使用QIAGEN专用于单细胞或少量细胞样本的分析试剂盒,即可了解单细胞基因组和转录组序列信息。创新的多重置换扩增(MDA)技术能够可靠扩增单细胞或少量样本中的全基因组或全转录组。

REPLI-g Single Cell Kit可均一的扩增单个细胞(1至1000个细菌或肿瘤细胞)或纯化的基因组DNA,能够覆盖基因组所有位点。所有缓冲液和试剂生产都经过严格控制的流程,避免污染DNA,确保每次实验获得可靠的结果。该产品采用多重置换扩增(MDA)技术,对所有基因组位点进行无偏差的扩增。与基于PCR的全基因组扩增技术相比,该技术具有更好的扩增高保真度,避免出现假阳性或假阴性信号。

REPLI-g Single Cell Kit含有REPLI-g sc Polymerase,这是一种优化的新型高保真Phi 29聚合酶。该试剂盒采用多重置换扩增技术扩增复杂的基因组DNA,温和的碱孵育能够避免DN**段化,促进对所有位点的无偏差扩增。该试剂盒十分适用于分离的肿瘤细胞或细菌细胞等单一细胞,能够扩增获得高产量DNA(参见表1)。此外,该试剂盒还配有专用于鲜血或干血、新鲜或冷冻组织的实验方案,可用于多种研究样本。常规DNA产量可达40 µg,对模板的起始量要求低,因此进行后续遗传分析时无需检测DNA浓度。REPLI-g Single Cell Kit的扩增产物平均长度超过10 kb,且覆盖所有位点,适合于多种应用,包括二代测序、基于芯片技术的比较基因组杂交、焦磷酸测序和real-time PCR分析(参见表2)。

表1. 样本类型和研究领域

样本类型(细胞/DNA)

研究领域

人类/动物

生物标记物研究(SNP、突变、CNV)

干细胞研究

循环胚胎细胞分析

嵌合体研究

遗传易感性研究

转基因动物基因分型

癌症

体细胞遗传变异分析

肿瘤恶化

肿瘤干细胞/进化

循环肿瘤细胞分析

细菌

宏观基因组学研究

病原体分析

微生物基因分型

Plants*

植物气孔研究

花粉分析

* 没有细胞壁的细胞或纯化的基因组DNA。

表2. 下游应用和仪器

应用

仪器

全基因组测序

二代测序平台†

外显子组测序

SNP基因分型芯片

芯片平台†

Array CGH

qPCR/PCR技术

Real-time PCR/PCR仪†

Sanger测序

毛细管测序仪†

焦磷酸测序

PyroMark (QIAGEN)

† 多家供应商均有销售

表3. REPLI-g Single Cell Kit的成

试剂盒成分

优势

REPLI-g sc Polymerase

最长可达70 kb的长片段

保真性是Taq聚合酶的1000倍

覆盖所有位点

均一扩增所有位点

REPLI-g sc Reaction Buffer‡

对所有位点进行无偏差的扩增

Buffer DLB (裂解和变性)

高效扩增

不损伤DNA

紫外线照射去除污染

减少可检测到的残留DNA污染

‡ 含有盐、引物和dNTP

    表 4. 多种REPLI-g Kits的规格

    产品名称

    REPLI-g Single Cell

    REPLI-g Mini

    REPLI-g UltraFast Mini

    REPLI-g Midi

    REPLI-g Screening

    REPLI-g FFPE

    REPLI-g Mitochondrial DNA

    产品货号

    150343/ 150345

    150023/ 150025

    150033/ 150035

    150043/ 150045

    150126

    150243/ 150245

    151023

    起始材料

    单一细胞、gDNA

    纯化的基因组DNA、血液、细胞

    纯化的基因组DNA、血液、细胞

    FFPE组织、FFPE组织中纯化的基因组DNA

    纯化的基因组DNA

    另外提供其他起始材料的实验方案

    起始量

    单一细胞、2–1000各细胞、组织、纯化的gDNA (1–10 ng)

    >10 ng gDNA、0.5 µl血液或细胞(>600个细胞/µl)

    >10 ng gDNA、0.5 µl血液或细胞(>600个细胞/µl)

    组织切片(直径1 cm,厚度10–40 µm);>100 ng gDNA

    >1 ng纯化的gDNA

    产量(µg/反应)

    40

    10

    7–10

    40

    8

    标准产量:≤10; 高产量:≤40

    3–5

    反应时间

    8–16小时

    10–16 小时

    1.5小时

    8–16小时

    12–16小时

    标准产量:4小时;高产量:10小时

    8小时

    手动操作时间

    15分钟

    15分钟

    15分钟

    15分钟

    15分钟

    40分钟

    15分钟

    规格

    反应管

    反应管

    反应管

    反应管

    孔板


    以上信息来源QIAGEN

    http://www.qiagen.com/cn/products/catalog/sample-technologies/dna-sample-technologies/genomic-dna/repli-g-single-cell-kit/#productdetails




    阅读原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2014100002.html

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